Entre las especies de cítricos, la naranja dulce (Citrus sinensis (L.) Osbeck) es la más importante en términos de volúmenes de producción y áreas cultivadas. Las naranjas son particularmente apreciadas por las características organolépticas y el alto valor nutracéutico de las frutas (gracias especialmente a su alto contenido de antioxidantes). Los avances recientes en recursos genéticos y genómicos de cítricos, como la liberación de los genomas de referencia de varios cultivares de naranja dulce, han contribuido a (i) comprender la diversificación de la especie y su relación con otras especies de cítricos, (ii) evaluar los mecanismos moleculares que subyacen a rasgos de interés, (iii) identificar y caracterizar los genes candidatos responsables de rasgos fenotípicos importantes, y (iv) desarrollar métodos biotecnológicos para incorporar estos rasgos en diferentes genotipos de cítricos. Se ha aclarado que toda la diversidad genética dentro de la especie de naranja dulce se derivó de mutaciones posteriores a partir de un solo ancestro y se derivó de ciclos complejos de hibridación y retrocruzamiento entre la mandarina (Citrus reticulata Blanco) y el pomelo (Citrus maxima (Burm.) Merr.). Este artículo proporciona una visión general del panorama varietal junto con una descripción de las principales fuerzas impulsoras en la cría presente y futura de naranja dulce. De hecho, para la naranja dulce, al igual que para otras especies de cítricos, se está buscando la liberación de nuevas variedades con características mejoradas gracias al empleo de métodos convencionales y/o innovadores (basados en la biología molecular). También se revisaron y discutieron los métodos de vanguardia junto con las innovaciones en genómica y herramientas biotecnológicas que conducen a las llamadas nuevas tecnologías de mejoramiento de plantas.