Tropaeolum tuberosum, comúnmente conocido como cubio, mashua o isaño, es un cultivo subutilizado perteneciente al grupo de los tubérculos andinos. Los cubios albergan una amplia variabilidad genética y morfológica, siendo los tubérculos los que presentan la mayor variación. La caracterización morfológica es un enfoque fundamental para evaluar la diversidad genética del cubio y constituye el primer paso crucial en la clasificación del germoplasma. También es determinante para las prácticas de conservación in situ que llevan a cabo los agricultores. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo explorar la diversidad morfológica de 15 accesiones de tubérculos de cubio de Colombia y Bolivia, y validar los hallazgos comparándolos con accesiones previamente publicadas. Con base en los descriptores morfológicos de los tubérculos, calculamos el índice de diversidad y realizamos análisis de componentes principales (PCA) y de agrupamiento en dos conjuntos de datos: (i) morfotipos colombianos y bolivianos y (ii) este último más datos de cubio previamente publicados. Se encontraron similitudes tanto en el índice de diversidad morfológica como en la agrupación de morfotipos entre los conjuntos de datos, lo que refuerza la validez de los rasgos morfológicos propuestos, a pesar del tamaño limitado de las muestras y la subjetividad inherente a la caracterización. Todas las accesiones se clasificaron correctamente como morfotipos distintos, lo que subraya la considerable variación morfológica presente en los cubios. Esta variación morfológica refleja la amplia gama subyacente.