Este estudio investiga la filogeografía y la genética de poblaciones del agama de cabeza de sapo de Qinghai en la meseta Qinghai-Tíbet. Analizamos datos genéticos de 130 nuevos individuos y de 253 individuos de GenBank e identificamos seis clados distintos, incluyendo una nueva línea genética y la subespecie en la ladera norte de las montañas Kunlun-Arjin. El estudio encontró una alta diversidad genética y una divergencia significativa entre los clados, impulsada por variables geográficas y ambientales. La ascendencia de la especie se remonta a 2.55 millones de años, influenciada por movimientos geológicos y ciclos glaciares. No hubo un declive poblacional durante el Último Máximo Glacial, y la modelización de nichos ecológicos predice una futura expansión del hábitat. Los datos morfológicos también confirmaron las diferencias entre clados, mejorando nuestra comprensión de la diversificación y adaptación a los cambios geológicos y climáticos en la región.