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Diversidad Genética e Identificación de Especies Vietnamitas Usando Secuencias de ADN

Autores: Vu, Huyen-Trang; Vu, Quoc-Luan; Nguyen, Thanh-Diem; Tran, Ngan; Nguyen, Thanh-Cong; Luu, Phuong-Nam; Tran, Duy-Duong; Nguyen, Truong-Khoa; Le, Ly

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2019

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Acceso abierto

Artículo científico
2019

Diversidad Genética e Identificación de Especies Vietnamitas Usando Secuencias de ADN


Categoría

Ciencias Naturales y Subdisciplinas

Subcategoría

Biología

Palabras clave

Flores de pantufla populares
Conservación
Código de barras de ADN
Métodos de identificación
Especies vietnamitas

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 17

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
es uno de los géneros de orquídeas ornamentales más populares debido a sus únicas flores en forma de zapato y atractiva coloración de las hojas. La mayoría de las especies están en peligro crítico debido a la sobreexplotación. Fueron incluidas en el Apéndice I de la Convención sobre el Comercio Internacional de Especies Amenazadas de Fauna y Flora Silvestres, que impide su comercio transfronterizo. Aunque la mayoría de las especies son distintivas, debido a sus respectivas flores, sus características vegetativas son más similares y poco diferenciadas. Por lo tanto, la conservación de estas especies es un desafío, ya que la mayoría de los especímenes comercializados son inmaduros y no florecidos. Existe una necesidad urgente de métodos de identificación efectivos para prevenir el comercio ilegal de especies. El código de barras de ADN es un método rápido y sensible para la identificación de especies, en cualquier etapa de desarrollo, utilizando secuencias cortas de ADN. En este estudio, se examinaron ocho loci, es decir, ITS, K, L, B y H-A, en busca de posibles secuencias de código de barras en las especies vietnamitas. En total, 17 de 22 especies fueron bien identificadas. Las secuencias de ADN estudiadas fueron depositadas en GenBank, donde se introdujeron accesiones por primera vez. K y H-A tuvieron una tasa de amplificación limitada para ITS. ITS fue el mejor código de barras único. El ITS único podría usarse junto con características de polimorfismo de nucleótidos para la discriminación de especies. La combinación de ITS + K fue el código de barras de identificación más eficiente para las especies vietnamitas. Este código de barras también tuvo éxito en el reconocimiento de muestras comercializadas mal identificadas o erróneamente nombradas. Diferentes programas y algoritmos de bioinformática para establecer árboles filogenéticos también se compararon en el estudio para proponer herramientas rápidas, simples y efectivas para uso práctico. Se demostró que tanto el método de Inferencia Bayesiana en el programa MRBAYES como el método de vecino más cercano en el software MEGA cumplían con los criterios. Nuestro estudio proporciona una base de datos de códigos de barras de especies vietnamitas que puede contribuir significativamente al control y conservación de estas valiosas especies.

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