Diversidad del rDNA 45S como un paso hacia la heterogeneidad ribosomal en
Autores: Delorme-Hinoux, Valérie; Mbodj, Assane; Brando, Sophie; De Bures, Anne; Llauro, Christel; Covato, Fabrice; Garrigue, Joseph; Guisset, Claude; Borrut, Jacques; Mirouze, Marie; Reichheld, Jean-Philippe; Sáez-Vásquez, Julio
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Diversidad del rDNA 45S como un paso hacia la heterogeneidad ribosomal en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Ribosoma
Rdna 45s
Diversidad
Genes de arn
Genotipos
Altitud
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
La piedra angular de la biogénesis del ribosoma es la transcripción del ADN ribosómico 45S. El genoma contiene cientos de unidades de ADN ribosómico 45S; sin embargo, no todas son transcritas. Notablemente, las unidades de ADN ribosómico 45S contienen inserciones/borrados que revelan la existencia de genes de ARN ribosómico heterogéneos y, probablemente, ribosomas heterogéneos para los ARN ribosómicos. Con el fin de obtener una visión general de la diversidad del ADN ribosómico 45S que sostiene la síntesis de ARN ribosómicos y, posteriormente, de ribosomas, aprovechamos 320 nuevas ocurrencias de una metapoblación llamada At66, muestreadas desde 0 hasta 1900 m de altitud en los Pirineos orientales en Francia. Encontramos que el número de copias de ADN ribosómico 45S es muy dinámico e identificamos nuevos genotipos tanto para los Espaciadores Transcritos Externos (ETS) 5 como 3. Curiosamente, la mayor diversidad de genotipos de 5ETS se encuentra en altitudes, mientras que la mayor diversidad de genotipos de 3ETS se encuentra a nivel del mar. El análisis estructural del ADN ribosómico 45S también muestra la conservación de secuencias/características específicas de 5ETS y 3ETS necesarias para controlar la expresión del ADN ribosómico y el procesamiento de los ARN ribosómicos. En conclusión, At66 es un laboratorio natural valioso, y la diversidad del ADN ribosómico 45S desvelada representa un material de partida interesante para seleccionar subconjuntos para la transcripción del ADN ribosómico y alterar la composición de ARN ribosómico de los ribosomas tanto intra como intersitio.
Descripción
La piedra angular de la biogénesis del ribosoma es la transcripción del ADN ribosómico 45S. El genoma contiene cientos de unidades de ADN ribosómico 45S; sin embargo, no todas son transcritas. Notablemente, las unidades de ADN ribosómico 45S contienen inserciones/borrados que revelan la existencia de genes de ARN ribosómico heterogéneos y, probablemente, ribosomas heterogéneos para los ARN ribosómicos. Con el fin de obtener una visión general de la diversidad del ADN ribosómico 45S que sostiene la síntesis de ARN ribosómicos y, posteriormente, de ribosomas, aprovechamos 320 nuevas ocurrencias de una metapoblación llamada At66, muestreadas desde 0 hasta 1900 m de altitud en los Pirineos orientales en Francia. Encontramos que el número de copias de ADN ribosómico 45S es muy dinámico e identificamos nuevos genotipos tanto para los Espaciadores Transcritos Externos (ETS) 5 como 3. Curiosamente, la mayor diversidad de genotipos de 5ETS se encuentra en altitudes, mientras que la mayor diversidad de genotipos de 3ETS se encuentra a nivel del mar. El análisis estructural del ADN ribosómico 45S también muestra la conservación de secuencias/características específicas de 5ETS y 3ETS necesarias para controlar la expresión del ADN ribosómico y el procesamiento de los ARN ribosómicos. En conclusión, At66 es un laboratorio natural valioso, y la diversidad del ADN ribosómico 45S desvelada representa un material de partida interesante para seleccionar subconjuntos para la transcripción del ADN ribosómico y alterar la composición de ARN ribosómico de los ribosomas tanto intra como intersitio.