Este estudio tuvo como objetivo investigar el perfil evolutivo (incluyendo diversidad, actividad y abundancia) de los retrotransposones (RTNs) con repeticiones terminales largas (LTRs) en diez especies. Estas especies son conocidas por tener los genomas más pequeños entre los vertebrados. La minería de datos reveló una alta diversidad y amplia distribución de retrotransposones LTR (LTR-RTNs) en estos genomas vertebrados compactos, con abundancias variables entre especies. Se identificaron un total de 819 secuencias LTR-RTN de longitud completa en estos genomas, categorizadas en nueve familias pertenecientes a cuatro superfamilias diferentes: ERV (Orthoretrovirinae y Epsilon retrovirus), Copia, BEL-PAO y Gypsy (Gmr, Mag, clado V, CsRN1 y Barthez). La superfamilia Gypsy mostró la mayor diversidad. La distribución de las familias LTR varió entre especies, siendo las especies con la mayor riqueza de familias y secuencias LTR. Además, se observó evidencia de invasiones recientes en genomas de tetraodontiformes específicos, lo que sugiere una posible actividad de transposición. Este estudio proporciona información sobre la evolución de los retrotransposones LTR, mejorando nuestra comprensión de su impacto en la estructura y evolución de los genomas hospedadores.