Esta es una breve revisión del estado del arte en cuanto a la diversidad de macrófitos acuáticos y los principales tipos de vegetación acuática en el humedal y la cuenca alta del Pantanal brasileño. Existen aproximadamente 280 especies de macrófitos acuáticos en la llanura aluvial del Pantanal, con escaso endemismo. En la cuenca alta, las veredas del Cerrado y los manantiales de piedra caliza presentan una flora distintiva de la del Pantanal, con el doble de riqueza de especies. Como caso representativo de hábitats acuáticos influenciados por inundaciones fluviales, se presentan algunos datos primarios del Parque Nacional Pantanal Matogrossense y la Reserva Acurizal asociada, analizando la similitud florística entre los tipos de vegetación acuática. Se comentan los problemas de conservación y se observa que Panicum elephantipes Nees es una de las pocas especies nativas que compite con la invasora Urochloa arrecta (Hack. ex T. Durand & Schinz) Morrone & Zuloaga.