Con el objetivo de contribuir a la comprensión de la multifuncionalidad de las plantas para la gestión sostenible de agroecosistemas, la primera parte de este documento aborda la importancia de la biodiversidad funcional en el diseño de sistemas agroecológicos, incluyendo el contexto local en la generación de conocimiento situado. La segunda parte describe tres experiencias de investigación participativa con agricultores locales en tres localidades de Chile. La primera experiencia informa sobre el uso de Dasyphyllum diacanthoides (árbol endémico) como forraje. Una segunda experiencia se centra en el establecimiento de Rosa spp. (especies invasoras) como un sistema agroforestal integrado en el paisaje. Ambas experiencias fueron esfuerzos colaborativos con comunidades de agricultores de la Cordillera de los Andes en el sur de Chile. La experiencia final describe el uso de diferentes plantas aromáticas y medicinales espontáneas a través de corredores biológicos para fomentar insectos beneficiosos como controladores naturales. Las tres experiencias de investigación revelan una falta de conocimiento, descontextualización y subvaloración de la diversidad biocultural presente en algunos agroecosistemas tradicionales chilenos.