Los asentamientos rurales están experimentando un proceso de reconstrucción en el contexto de la rápida urbanización, lo que tiene un impacto significativo en la tierra ecológica. Sin embargo, los asentamientos rurales que invaden tierras ecológicas (RSEEL) y sus efectos ecológicos asociados han sido ampliamente ignorados. Este artículo tiene como objetivo evaluar de manera precisa y cuantitativa la perturbación ecológica causada por RSEEL en las áreas de rápida urbanización de China. Se aplicó un índice de perturbación ecológica que combina cambios tanto en la escala como en la fragmentación en Nantong, en el este de China. Se identificaron tres tipos, incluyendo expansión por salto, difusión de extensión y llenado interno, en RSEEL. Los resultados muestran que el tipo de expansión por salto representó la mayor proporción (58.39%) a nivel de parches, mientras que la difusión de extensión fue el tipo dominante a nivel de aldea, y el tipo de llenado interno fue el menos común. RSEEL, inesperadamente, no hizo que la tierra ecológica fuera más fragmentada debido a la preferencia por parches independientes pequeños en la mayoría de los casos de invasión; por lo tanto, el grado de perturbación ecológica causado por RSEEL fue bajo en la mayoría de las áreas de Nantong. Cuando se combinó el tipo de invasión de RSEEL con el grado de perturbación ecológica, se encontró que la perturbación ecológica causada por el tipo de expansión por salto fue mayor que la de los otros dos tipos, y la difusión de extensión y la perturbación de bajo nivel fue el patrón principal observado en las aldeas. Los hallazgos contribuirán a nuestra comprensión de la relación dinámica entre el asentamiento rural y la tierra ecológica y proporcionarán información valiosa para la reconstrucción de asentamientos rurales bajo la civilización ecológica.