Este documento presenta el desarrollo de un marco de simulación por computadora, diseñado como una alternativa rentable y técnicamente eficiente a los estudios experimentales. El marco se centra en el Sistema de Polvo Bio-Neural propuesto en nuestros trabajos anteriores, que consta de dos componentes: un biosensor de bio-nanopartículas que emite luz y una neurona genéticamente modificada que expresa opsina. Este sistema innovador tiene un gran potencial para aplicaciones en la investigación en neurociencia y biotecnología. Programado en Python, el marco proporciona a los investigadores una herramienta virtual para probar y evaluar el Sistema de Polvo Bio-Neural, permitiendo la predicción de resultados para futuros experimentos in vivo. Este enfoque no solo conserva recursos, sino que también ofrece a los científicos un medio flexible y accesible para investigar las complejas interacciones dentro del sistema antes de las aplicaciones del mundo real. La adaptabilidad del marco y su potencial para diversas aplicaciones de investigación resaltan su importancia en el avance del campo de la bio-nanotecnología.