En este artículo, investigamos interfaces soportadas por ontologías para tareas de búsqueda en informática de la salud que involucran grandes conjuntos de documentos. Comenzamos proporcionando antecedentes sobre informática de la salud, aprendizaje automático y ontologías. Revisamos la investigación líder sobre tareas de búsqueda en informática de la salud para ayudar a formular criterios de diseño de alto nivel. Utilizamos estos criterios para examinar estrategias de diseño tradicionales para interfaces de búsqueda. Para demostrar la utilidad de los criterios, los aplicamos al diseño de la Interfaz de Búsqueda Soportada por Ontologías (ONTSI), un sistema prototipo demostrativo. ONTSI permite a los usuarios conectar y utilizar conjuntos de documentos y ontologías de dominio definidas por expertos a través de una interfaz de búsqueda generalizada. El objetivo de ONTSI es ayudar a alinear el vocabulario común de los usuarios con el vocabulario específico del dominio del conjunto de documentos plug-and-play. Describimos el funcionamiento y la utilidad de ONTSI en tareas de búsqueda en informática de la salud a través de un flujo de trabajo y un escenario. Concluimos con un resumen de las evaluaciones en curso, limitaciones e investigaciones futuras.