Dinámicas Evolutivas de Genes MADS-Box tipo -en Brassicaceae
Autores: Gramzow, Lydia; Sharma, Renu; Theißen, Günter
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Dinámicas Evolutivas de Genes MADS-Box tipo -en Brassicaceae
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Genes mads-box
Identidad de órganos florales
Brassicaceae
Contexto filogenético
Dinámicas evolutivas
Genes duplicados en tándem
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 10
Citaciones: Sin citaciones
Los genes MADS-box codifican factores de transcripción que desempeñan roles importantes en el desarrollo y la evolución de las plantas. Hay más de una docena de clados de genes MADS-box en las angiospermas, de los cuales aquellos con funciones en la especificación de la identidad de los órganos florales son especialmente conocidos. A partir de lo que se ha elucidado en la planta modelo, el clado de genes MADS-box similares a -son algo especiales entre los genes MADS-box de las plantas, ya que los genes similares a -, especialmente los genes similares a -, muestran dinámicas evolutivas inusuales, en el sentido de que generan grupos de genes duplicados en tándem. Aquí, utilizamos los últimos datos genómicos de Brassicaceae para estudiar esta característica notable de los genes similares a -en un contexto filogenético. Hemos identificado todos los genes similares a -en los genomas de 29 especies de Brassicaceae y reconstruido la filogenia de estos genes empleando un método de Máxima Verosimilitud. Además, realizamos análisis de selección utilizando PAML. Nuestros resultados revelan que hay tres clados principales de genes similares a -en Brassicaceae que evolucionan bajo selección purificadora pero con fuerzas notablemente diferentes. Confirmamos que la disposición en tándem de los genes similares a -en los genomas de Brassicaceae resultó en una alta tasa de duplicaciones y pérdidas. Curiosamente, los genes similares a -también parecen ser propensos a la transposición. Considerando el papel de los genes similares a -en el momento de la transición floral, hipotetizamos que esta rápida evolución de los genes similares a -fue un contribuyente principal a la exitosa adaptación de Brassicaceae a diferentes entornos.
Descripción
Los genes MADS-box codifican factores de transcripción que desempeñan roles importantes en el desarrollo y la evolución de las plantas. Hay más de una docena de clados de genes MADS-box en las angiospermas, de los cuales aquellos con funciones en la especificación de la identidad de los órganos florales son especialmente conocidos. A partir de lo que se ha elucidado en la planta modelo, el clado de genes MADS-box similares a -son algo especiales entre los genes MADS-box de las plantas, ya que los genes similares a -, especialmente los genes similares a -, muestran dinámicas evolutivas inusuales, en el sentido de que generan grupos de genes duplicados en tándem. Aquí, utilizamos los últimos datos genómicos de Brassicaceae para estudiar esta característica notable de los genes similares a -en un contexto filogenético. Hemos identificado todos los genes similares a -en los genomas de 29 especies de Brassicaceae y reconstruido la filogenia de estos genes empleando un método de Máxima Verosimilitud. Además, realizamos análisis de selección utilizando PAML. Nuestros resultados revelan que hay tres clados principales de genes similares a -en Brassicaceae que evolucionan bajo selección purificadora pero con fuerzas notablemente diferentes. Confirmamos que la disposición en tándem de los genes similares a -en los genomas de Brassicaceae resultó en una alta tasa de duplicaciones y pérdidas. Curiosamente, los genes similares a -también parecen ser propensos a la transposición. Considerando el papel de los genes similares a -en el momento de la transición floral, hipotetizamos que esta rápida evolución de los genes similares a -fue un contribuyente principal a la exitosa adaptación de Brassicaceae a diferentes entornos.