Este estudio tuvo como objetivo comparar los efectos de la inclusión de harina de copra hidrolizada (HCM) al 1% sobre su digestibilidad in vitro y la microbiota y fermentación del ciego utilizando la microbiota intestinal de cerdos destetados, enfocándose en la comunidad microbiana y los ácidos grasos de cadena corta (SCF). Por esta razón, se consideraron tres tratamientos: control (sin harina de copra), 1% de harina de copra no hidrolizada (CM) y 1% de HCM. La harina de copra no desgrasada fue hidrolizada y analizada (azúcares reductores y carbohidratos totales) en nuestro laboratorio. Para la digestión, identificación de microbiota y ensayos de fermentación, se utilizaron muestras fecales frescas de dos cerdos destetados (de 1 mes de edad). Se emplearon tres réplicas de cada tratamiento. HCM fue más digestible, con aproximadamente 0.68 g de hidrolizado recuperado después de la digestión simulada en comparación con 0.82 g de hidrolizado recuperado de CM. Esto fue demostrado por imágenes de Microscopía Electrónica de Barrido (SEM). Además, los tres cerdos compartieron la mayoría de las especies microbianas identificadas a nivel de filo y familia. No hubo diferencias (> 0.05) entre tratamientos en la comunidad microbiana y SCFA durante la fermentación. Sin embargo, se observaron índices de Chao-1 y Shannon más altos en los tratamientos de CM y HCM. También se encontró que HCM era capaz de preservar y a nivel de filo, mientras que a nivel de familia, ambos tratamientos pueden ayudar a sobrevivir a largo plazo. Además, hubo una tendencia potencial de aumento del ácido acético y ácido butírico en los tratamientos de CM y HCM. Si bien HCM muestra promesas en la posible modulación de la microbiota intestinal de cerdos destetados, se requiere investigación adicional para investigar los efectos de dosis más altas de HCM en los parámetros de rendimiento de los cerdos.