La sequía es un factor ambiental importante que influye en los procesos fisiológicos de las plantas; sin embargo, pocos estudios han examinado los mecanismos fisiológicos subyacentes a las respuestas de las plantas a la sequía continua. En este estudio, las plántulas y los individuos más jóvenes fueron plantados experimentalmente en la parte sur del desierto de Gurbantunggut. Medimos sus características fotosintéticas, características funcionales y contenidos de carbohidratos no estructurales (CNE) para evaluar los efectos de la sequía continua (en puntos de sequía de 15 y 30 días) en las respuestas fisiológicas de las plantas. Los resultados mostraron que en el punto de sequía de 15 días, los valores de la tasa fotosintética neta saturada por luz (A) tanto de las plántulas como de los individuos más jóvenes disminuyeron (en un -68.9% y -45.2%, respectivamente). La eficiencia intrínseca en el uso del agua (iWUE) de las plántulas fue significativamente menor que la del grupo de control (-52.2%), pero no se observó diferencia en la iWUE en los individuos más jóvenes. En el punto de sequía de 30 días, se indujo una disminución en la A (-129.8%) de las plántulas a través de una inhibición bioquímica, con una tasa fotochemical máxima potencial más baja (Fv/Fm, 0.42) en comparación con el grupo de control, mientras que una disminución en la A (-52.3%) de los individuos más jóvenes se indujo debido a una menor conductancia estomática (g, -50.5%). Nuestros resultados indicaron que la sequía prolongada indujo un mayor riesgo de mortalidad en las plántulas, ya que la capacidad relativamente limitada de regulación estomática puede aumentar la posibilidad de embolismo masivo, resultando en un fallo hidráulico.