El efecto de la raza en los componentes de la leche: grasa, proteína, lactosa y agua, ha demostrado ser significativo. Dado que la grasa es uno de los principales factores que determinan el precio de la leche, explorar las variaciones en los QTL de grasa entre razas arrojaría luz sobre el contenido variable de grasa en su leche. Aquí, en la secuenciación del genoma completo, se exploraron 25 QTL de grasa expresados diferencialmente como cuellos de botella para variaciones entre razas indígenas. De estos, se identificaron 20 genes con sustituciones no sinónimas. Se identificó un patrón fijo de SNP en razas de alta producción de leche en comparación con razas de baja producción de leche en los genes y, viceversa, en los genes y. Los SNP identificados fueron ratificados por pirosecuenciación para demostrar que existen diferencias clave en los QTL de grasa entre las razas de alta y baja producción de leche.