Los ácidos orgánicos son componentes clave que determinan el sabor y el aroma de las frutas, desempeñando un papel crucial en el mantenimiento de la calidad y el valor nutricional de las frutas. Para investigar las diferencias metabólicas de los ácidos orgánicos entre el pericarpio de la fruta y la pulpa durante la maduración, este experimento utilizó cultivos en Mongolia Interior, China, como material experimental. Al medir el contenido de ácido málico y ácido cítrico, así como las actividades de las enzimas metabólicas relacionadas en el pericarpio de la fruta y la pulpa en cinco etapas de desarrollo, este estudio investigó las características de acumulación de ácidos orgánicos, los cambios en las actividades enzimáticas y las tendencias de expresión de los genes correspondientes. Se integraron datos transcriptómicos para apoyar el análisis. Este estudio analizó específicamente las razones de las diferencias en acidez entre el pericarpio y la pulpa, y realizó un análisis de correlación de varios indicadores. Los resultados indicaron que, durante el desarrollo, la composición de ácidos orgánicos tanto en el pericarpio como en la pulpa era principalmente ácido málico, con ácido cítrico como componente secundario. El contenido de ácido málico y ácido cítrico en el pericarpio fue significativamente mayor que en la pulpa, resultando en una mayor acidez general en el pericarpio. La acción combinada de PEPC, NAD-MDH y NADP-ME se identificó como la razón principal de las diferencias en el contenido de ácido málico entre el pericarpio y la pulpa. CS y ACO se identificaron como las enzimas clave responsables del menor contenido de ácido cítrico en la pulpa en comparación con el pericarpio. Además, los niveles de expresión de , , , , , y diferían significativamente entre el pericarpio de la fruta y la pulpa, sugiriendo sus roles regulatorios en la acumulación de ácidos orgánicos.