En los mamíferos, los oocitos se desarrollan dentro de los folículos ováricos; este proceso está fuertemente apoyado por el entorno folicular circundante que consiste en células de cúmulo, granulosa y teca, y líquido folicular. En el folículo antral, las etapas finales de la oogénesis requieren grandes cantidades de energía que es producida por las células foliculares a partir de sustratos que incluyen glucosa, aminoácidos y ácidos grasos (AG). Dado que el metabolismo de lípidos juega un papel importante en la adquisición de la competencia de desarrollo del oocito, el objetivo de este estudio fue investigar la especificidad del sitio del metabolismo de lípidos en los ovarios comparando los perfiles lipídicos y la expresión de genes relacionados con el metabolismo de AG en diferentes compartimentos ováricos. Utilizando la imagenología de espectrometría de masas MALDI, se reconstruyeron imágenes de secciones de ovario porcino a partir de señales de iones lipídicos por primera vez. El análisis de clúster de espectros de iones reveló diferencias en la distribución espacial de especies lipídicas entre los compartimentos ováricos, notablemente entre los folículos y el tejido intersticial. Dentro de los folículos, el análisis diferenciaba el líquido folicular, la granulosa, la teca y el complejo oocito-cúmulo. Además, mediante la cuantificación de transcritos utilizando PCR en tiempo real, mostramos que la expresión de cinco genes clave en el metabolismo de AG variaba significativamente entre las células foliculares somáticas (teca, granulosa y cúmulo) y el oocito. En conclusión, el metabolismo de lípidos difiere entre los compartimentos ováricos y foliculares.