El volumen de materia orgánica del suelo (SOM) cambia debido a variaciones en los sistemas de labranza. La labranza de conservación (CT) es un método útil para recuperar el contenido de SOM en los campos de cultivo. Sin embargo, se sabe poco sobre la composición de SOM asociada a limo y arcilla y la materia orgánica oculta en agregados (OM). El presente estudio tuvo como objetivo determinar las composiciones de SOM de varias fracciones de SOM en el mismo Luvisol en un bosque nativo y bajo arado y CT. Las fracciones de SOM (asociadas a limo y arcilla; asociadas a arena y agregados; OM restringida) se caracterizaron utilizando espectroscopía infrarroja por transformada de Fourier de reflectancia difusa (FTIR). El tamaño de ambos grupos de SOM ocultos en agregados y resistentes aumentó debido al cambio en el sistema de labranza a CT durante 15 años. Como tendencia general, el contenido de carbono orgánico del suelo fue inversamente proporcional a la aromaticidad en ambos campos de cultivo, lo que respaldó la mineralización preferencial de componentes alifáticos en cada fracción. El cambio en el sistema de labranza podría desencadenar cambios cualitativos rápidos incluso en los grupos de carbono restringido estables; sin embargo, fue difícil distinguir entre el papel de OM y la composición mineral en los espectros de FTIR. En particular, los complejos orgánico-minerales relacionados con la arcilla podrían causar dificultades en los métodos de interpretación tradicionales.