En este estudio, investigamos las diferencias en los hábitos alimentarios de la ictiofauna de pequeño tamaño entre lagunas laterales y el cauce del río en un gran embalse. El estudio se realizó en cuatro lagunas y en un sitio de muestreo del cauce principal del embalse Rosana, río Paranapanema, Brasil. Las muestras se tomaron en septiembre y noviembre de 2004 y en enero, marzo, mayo y agosto de 2005. Los peces se muestrearon con una red de mano de 7,5 m². Se realizaron cinco lanzamientos manuales hacia rodales de macrófitos acuáticos. El diseño de muestreo favoreció la recolección de fauna íctica de pequeño tamaño (juveniles/especies de pequeño tamaño). Se analizó el contenido estomacal de 42 especies. Los peces consumieron un total de 183 alimentos diferentes. Estos alimentos se agruparon en 11 categorías de alimentos, que se utilizaron para clasificar a los peces en siete gremios tróficos. Los insectos acuáticos fueron consumidos por 32 especies y constituyeron el alimento predominante. En el río, los alimentos más consumidos fueron insectos acuáticos, cladóceros y fitoplancton, mientras que en las lagunas, los insectos acuáticos, copépodos y cladóceros fueron los principales. Al comparar cada gremio trófico, el número de especies insectívoras, algívoras y zooplanctívoras fue mayor en las lagunas que en el río, y lo contrario solo se observó en los peces omnívoros. La baja anchura del nicho en todos los sitios indica una alta especialización trófica y una baja superposición de nichos entre pares de especies. La asociación de peces en las lagunas laterales presenta hábitos alimentarios distintos a los de las especies fluviales, lo que indica que la coexistencia y la alta abundancia de peces pequeños en los sitios de muestreo se explican por su alta adaptabilidad alimentaria, que incluye una tendencia a la especialización dietética, una baja superposición alimentaria y la distribución de recursos, junto con diferentes usos temporales de los recursos.