Diez plastidios de (Crassulaceae) y implicaciones filogenéticas
Autores: Ding, Hengwu; Han, Shiyun; Ye, Yuanxin; Bi, De; Zhang, Sijia; Yi, Ran; Gao, Jinming; Yang, Jianke; Wu, Longhua; Kan, Xianzhao
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2022
Acceso abierto
Artículo científico
2022
Diez plastidios de (Crassulaceae) y implicaciones filogenéticas
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Género
Plastidomas
Uso de codones
Tasas evolutivas
Crassulaceae
Implicaciones filogenéticas
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 14
Citaciones: Sin citaciones
El género es el segundo más grande de la familia Crassulaceae, con unas 200 especies. Como un supercódigo de barras reconocido, los plastidios han sido ampliamente utilizados para estudios evolutivos de plantas. Aquí, informamos por primera vez sobre 10 nuevos plastidios de . Además, nos centramos en las caracterizaciones estructurales, el uso de codones, los patrones de aversión y las tasas evolutivas de los plastidios. Los patrones de unión IR-IRb tuvieron una expansión de 110 pb a -y fueron conservadores entre especies. Curiosamente, encontramos que los patrones de uso de codones del gen en especies son únicos entre las especies de Crassulaceae con valores ENC elevados. Además, las especies del subgénero tienen sesgos específicos de GC en el gen. Además, los motivos de aversión de codones de , , y contenían implicaciones filogenéticas dentro de . Los análisis de tasas evolutivas indicaron que todos los genes plastidiales de Crassulaceae estaban bajo selección purificadora. Entre los genes plastidiales, y fueron los genes que evolucionaron más rápidamente, mientras que fue el gen más conservado. Además, nuestros análisis filogenéticos apoyaron fuertemente que es hermana de todas las demás especies de Crassulaceae. Nuestros hallazgos serán útiles para futuros estudios evolutivos dentro de y Crassulaceae.
Descripción
El género es el segundo más grande de la familia Crassulaceae, con unas 200 especies. Como un supercódigo de barras reconocido, los plastidios han sido ampliamente utilizados para estudios evolutivos de plantas. Aquí, informamos por primera vez sobre 10 nuevos plastidios de . Además, nos centramos en las caracterizaciones estructurales, el uso de codones, los patrones de aversión y las tasas evolutivas de los plastidios. Los patrones de unión IR-IRb tuvieron una expansión de 110 pb a -y fueron conservadores entre especies. Curiosamente, encontramos que los patrones de uso de codones del gen en especies son únicos entre las especies de Crassulaceae con valores ENC elevados. Además, las especies del subgénero tienen sesgos específicos de GC en el gen. Además, los motivos de aversión de codones de , , y contenían implicaciones filogenéticas dentro de . Los análisis de tasas evolutivas indicaron que todos los genes plastidiales de Crassulaceae estaban bajo selección purificadora. Entre los genes plastidiales, y fueron los genes que evolucionaron más rápidamente, mientras que fue el gen más conservado. Además, nuestros análisis filogenéticos apoyaron fuertemente que es hermana de todas las demás especies de Crassulaceae. Nuestros hallazgos serán útiles para futuros estudios evolutivos dentro de y Crassulaceae.