El uso de piensos funcionales en acuicultura está aumentando actualmente. Este estudio tuvo como objetivo evaluar el impacto combinado de las microalgas verdes dietéticas y el DCF12.2 inactivado por etanol (dieta CVP) en peces juveniles de lisa de labios gruesos. Se investigaron los efectos sobre la microbiota intestinal y la transcripción de genes relacionados con el metabolismo, el estrés y el sistema inmunológico después de 90 días de alimentación. Además, los peces fueron desafiados con ácido poliinosinico-policitídilico (poly I:C) para evaluar la respuesta inmune. El análisis de la microbiota no reveló diferencias significativas en la diversidad alfa y beta entre las secciones intestinales anterior y posterior de los peces alimentados con las dietas de control (CT) y CVP. Los géneros dominantes variaron entre los grupos; y fueron más abundantes en el grupo CVP, mientras que , , y fueron predominantes en el grupo CT. Sin embargo, la funcionalidad microbiana permaneció sin alteraciones. El análisis de expresión génica indicó cambios notables en , , , , y genes en diferentes órganos de los peces en la dieta CVP. En el riñón cefálico, se observaron variaciones en la expresión génica tras los desafíos con o poly I:C, con valores máximos más altos en los peces inyectados con poly I:C. Además, los niveles de ARNm se regulaban significativamente al alza en el grupo CVP 72 h después del desafío. Para concluir, la incorporación de en la dieta afectó la composición de especies microbianas en el intestino mientras se preservaba su funcionalidad. En términos de expresión génica, la dieta combinada reguló eficazmente la transcripción de genes relacionados con el estrés y la inmunidad, sugiriendo un posible aumento de la resistencia de los peces contra el estrés y las infecciones.