La acumulación de compuestos de reserva (es decir, lípidos y crisolaminarina) en las diatomeas depende de las condiciones ambientales y a menudo se desencadena por condiciones de estrés, como la limitación de nutrientes. La manipulación del suministro de CO también se puede utilizar para mejorar tanto la acumulación de lípidos como de carbohidratos. Dada la alta diversidad entre las diatomeas, estudiamos dos diatomeas marinas modelo y una diatomea de agua dulce, encontradas en ambientes de agua dulce y salada. Medimos la acumulación de compuestos de reserva y la actividad de las enzimas involucradas en el metabolismo del carbono en estas diatomeas cultivadas en CO alto y atmosférico. Observamos que la biomasa y la acumulación de lípidos en las células cultivadas en CO alto difieren entre las diatomeas. La acumulación de lípidos aumentó solo en las diatomeas cultivadas en agua de mar en respuesta a un CO elevado. Además, la acumulación de lípidos también fue acompañada por un aumento en la actividad de las enzimas probadas. Sin embargo, la acumulación de lípidos y la actividad enzimática disminuyeron en las diatomeas cultivadas en agua dulce. La acumulación de crisolaminarina también se vio afectada por la concentración de CO; sin embargo, no hubo una relación clara con la acumulación de lípidos. Nuestros resultados son relevantes para entender mejor el papel ecológico del ambiente en la adaptación de las diatomeas al CO y los mecanismos que sustentan la producción de compuestos de almacenamiento considerando la diversidad de las diatomeas.