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Recombinase polymerase amplification assay para el diagnóstico rápido en campo del patógeno de la marchitez de Stewart del maíz

Autores: Cai, Lulu; Tian, Qian; Meng, Qingqing; Bao, Xiaoyang; Xu, Peidong; Liu, Ji; Zhao, Wenjun; Wang, Hui

Idioma: Inglés

Editor: MDPI

Año: 2023

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Acceso abierto

Artículo científico
2023

Recombinase polymerase amplification assay para el diagnóstico rápido en campo del patógeno de la marchitez de Stewart del maíz


Categoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas

Subcategoría

Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales

Palabras clave

Marchitez de Stewart
Marchitez vascular
Tizón foliar
Maíz dulce
Amplificación de polimerasa de recombinasa
Dispositivo de flujo lateral

Licencia

CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual

Consultas: 20

Citaciones: Sin citaciones


Descripción
La marchitez vascular de Stewart y la quema de hojas del maíz dulce son causadas por la bacteria entérica Gram-negativa subsp. . La marchitez de Stewart resulta en pérdidas significativas de rendimiento en todo el mundo, lo que justifica un diagnóstico rápido y preciso de la enfermedad. La amplificación de polimerasa de recombinasa (RPA) es una técnica isotérmica que es tolerante a los inhibidores derivados de la planta huésped y, por lo tanto, es ideal para la detección rápida en el campo de ensayos moleculares basados en la reacción de polimerasa tradicional. Se desarrolló un ensayo de RPA combinado con un Dispositivo de Flujo Lateral (LFD) para la detección en tiempo real rápida, precisa y sensible de subsp. directamente desde el huésped infectado, ofreciendo detección de patógenos en el campo, manejo oportuno de la enfermedad y satisfaciendo los requisitos de cuarentena y fitosanitarios. Se diseñaron doce nuevos juegos de cebadores contra regiones genómicas conservadas de subsp. ; sin embargo, solo los cebadores para la amplificación de la región espaciadora intergénica entre los genes de polisacáridos capsulares y fueron claramente únicos y adecuados para la identificación inequívoca de subsp. . Los cebadores específicos de subsp. fueron validados posteriormente en un ensayo de RPA simple para la especificidad contra veintiséis especies bacterianas representativas de varias y otras especies/subespecies/cepas bacterianas estrechamente relacionadas encontradas en el mismo nicho, y muestras de plantas infectadas natural o artificialmente. El ensayo integrado de RPA/LFD también se optimizó para la detección rápida y sensible en el sitio de subsp. con un límite de detección empírico de 0.0005 pg de ADN bacteriano por L y 1 x 10 UFC/mL (aprox. dos células bacterianas utilizadas por reacción de RPA) en muestras mínimamente procesadas para un diagnóstico preciso, económico y en el punto de necesidad del patógeno de cuarentena subsp. .

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