Este estudio tuvo como objetivo evaluar las influencias de la devolución de paja a corto plazo combinada con fertilizante de nitrógeno (N) en el rendimiento de los cultivos, las propiedades del suelo, la comunidad bacteriana y la abundancia de genes de ciclado de nitrógeno en un sistema de cultivo de arroz-colza. Se realizó un experimento de campo de dos años en un arrozal de 2019 a 2021. Había cuatro tratamientos en el experimento: -N-S, sin aplicación de N y sin devolución de paja; -N+S, sin aplicación de N con devolución de paja; +N-S, aplicación de N sin devolución de paja; y +N+S, aplicación de N con devolución de paja. Los resultados mostraron que la devolución de paja a corto plazo combinada con fertilizante de N podría aumentar el rendimiento de los cultivos y la eficiencia en el uso de N. La aplicación de fertilizante de N tuvo un efecto positivo en la abundancia. La devolución de paja tuvo un efecto positivo en la abundancia. La fertilización con N aumentó significativamente la abundancia de -AOA, -AOB y en suelos agrícolas. La devolución de paja y la fertilización con N no fueron propicias para la desnitrificación. Concluimos que la devolución de paja a corto plazo combinada con fertilizante de N en áreas de cultivo de arroz no solo aumenta el rendimiento de los cultivos y mejora la absorción de N de los cultivos, sino que también aumenta la Materia Orgánica del Suelo, el N total y NH y mejora la actividad microbiana del suelo y la eficiencia en el uso de N.