Detección y control de la pudrición blanda en mediante ensayos de amplificación isotérmica mediada por bucle
Autores: Xiao, Caiyun; Li, Rongyu
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2021
Acceso abierto
Artículo científico
2021
Detección y control de la pudrición blanda en mediante ensayos de amplificación isotérmica mediada por bucle
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Podredumbre blanda
Detección
Ensayo LAMP
Cebadores
Amplificación
Control
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
La pudrición blanda es una de las enfermedades más destructivas de Kimura et Migo en China que reduce el rendimiento y la calidad. Un desafío clave para una estrategia de manejo integrado de esta enfermedad es la detección rápida y precisa de . Por lo tanto, se desarrolló un nuevo ensayo de amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) con este propósito. En este estudio, se seleccionaron y diseñaron los cebadores utilizando la región del gen del factor de elongación de la traducción-1alfa () como la secuencia de ADN objetivo para seleccionar el mejor sistema de reacción de LAMP para detectar mediante la optimización de diferentes condiciones de la reacción LAMP, incluyendo tiempo, temperatura, concentraciones de MgSO y concentraciones de cebadores internos y externos. El sistema optimizado pudo amplificar eficientemente el gen objetivo a 62 grados C durante 60 minutos con 1.2 M de cebadores internos, 0.4 M de cebadores externos, 7 mM de Mg y una concentración mínima de detección de ADN de 5 fg/uL para . Los productos amplificados pudieron ser detectados a simple vista tras la finalización de la reacción con SYBR green I. Pudimos controlar mejor el efecto de la pudrición blanda utilizando fungicidas tras un resultado positivo de la prueba. Además, el efecto de control de las combinaciones de sinergismo contra la pudrición blanda fue superior al 75%. Así, los ensayos LAMP podrían detectar en tejidos infectados de y suelos en campo, permitiendo un diagnóstico temprano de la enfermedad.
Descripción
La pudrición blanda es una de las enfermedades más destructivas de Kimura et Migo en China que reduce el rendimiento y la calidad. Un desafío clave para una estrategia de manejo integrado de esta enfermedad es la detección rápida y precisa de . Por lo tanto, se desarrolló un nuevo ensayo de amplificación isotérmica mediada por bucle (LAMP) con este propósito. En este estudio, se seleccionaron y diseñaron los cebadores utilizando la región del gen del factor de elongación de la traducción-1alfa () como la secuencia de ADN objetivo para seleccionar el mejor sistema de reacción de LAMP para detectar mediante la optimización de diferentes condiciones de la reacción LAMP, incluyendo tiempo, temperatura, concentraciones de MgSO y concentraciones de cebadores internos y externos. El sistema optimizado pudo amplificar eficientemente el gen objetivo a 62 grados C durante 60 minutos con 1.2 M de cebadores internos, 0.4 M de cebadores externos, 7 mM de Mg y una concentración mínima de detección de ADN de 5 fg/uL para . Los productos amplificados pudieron ser detectados a simple vista tras la finalización de la reacción con SYBR green I. Pudimos controlar mejor el efecto de la pudrición blanda utilizando fungicidas tras un resultado positivo de la prueba. Además, el efecto de control de las combinaciones de sinergismo contra la pudrición blanda fue superior al 75%. Así, los ensayos LAMP podrían detectar en tejidos infectados de y suelos en campo, permitiendo un diagnóstico temprano de la enfermedad.