En este estudio, se examinaron secciones delgadas de riñón de ratones sanos y de aquellos infectados que llevaron a sepsis aguda y crónica mediante imágenes de fluorescencia de por vida excitada por dos fotones (2P-FLIM) utilizando los coenzimas fluorescentes endógenos nicotinamida adenina dinucleótido (NADH) y flavina adenina dinucleótido (FAD). Los resultados presentados muestran que este enfoque es una herramienta poderosa para investigar el metabolismo celular en secciones delgadas de tejido. Se estableció una rutina de medición adaptada para estas muestras realizando un escaneo espectral, identificando una combinación de dos longitudes de onda de excitación y dos rangos de detección adecuados para imágenes detalladas de escaneo de NADH y FAD. Se estudiaron posiciones seleccionadas en rebanadas delgadas de la corteza renal de nueve ratones (tres sanos, tres con sepsis crónica y tres con sepsis aguda) utilizando 2P-FLIM. Además, se obtuvieron imágenes generales utilizando la intensidad de fluorescencia excitada por dos fotones (2PEF). Este estudio muestra que las rebanadas de riñón sanas difieren considerablemente de las que tienen sepsis aguda en cuanto a sus firmas de vida útil de fluorescencia. Estas últimas muestran una diferencia en el metabolismo entre la corteza interna y externa, indicando que las células tubulares corticales externas cambian su metabolismo de la fosforilación oxidativa a la glucólisis en riñones de ratones con sepsis aguda y vuelven en etapas posteriores, como se observa en ratones con infecciones crónicas. Estos hallazgos sugieren que 2P-FLIM podría servir como una herramienta poderosa para el diagnóstico de sepsis en etapas tempranas y para monitorear la recuperación metabólica durante el tratamiento.