El encharcamiento puede reducir el rendimiento de los cultivos en un 20%-50% o más, y la falta de métodos de selección eficientes es un obstáculo en la cría de plantas. Los métodos actualmente utilizados son principalmente índices basados en la capacidad de germinación en placas de Petri y en la clorosis foliar en plantas cultivadas en suelos encharcados. El cultivo en solución de nutrientes con oxígeno depletado es el sistema definitivo de encharcamiento. Por lo tanto, se evaluaron métodos basados en la inhibición del crecimiento de raíces y en la fluorescencia en material vegetal cultivado hidropónicamente en solución con oxígeno depletado en comparación con datos sobre la acumulación de biomasa en suelos encharcados. Ambos rasgos se correlacionaron con la tolerancia al encharcamiento en el suelo, pero dado que era más fácil medir la fluorescencia, este método fue evaluado aún más. Una selección de plantas con alta y baja fluorescencia reveló un efecto de cribado pequeño pero significativo en las plantas. Una prueba de 175 cultivares nórdicos mostró grandes variaciones en la fluorescencia de la clorofila en hojas de plántulas estresadas por oxígeno, lo que indica que la adaptación al encharcamiento ha mejorado gradualmente en los últimos 40-50 años con la introducción de nuevos cultivares en el mercado. Sin embargo, la precipitación también aumentó durante el período y los nuevos cultivares pueden haber sido adaptados inadvertidamente a esto mientras se criaba cebada para el rendimiento de grano. Los resultados sugieren que el método hidropónico puede ser utilizado para el cribado de poblaciones de cebada, líneas de cría o fenotipado de poblaciones en el desarrollo de marcadores para loci de rasgos cuantitativos.