Las variedades de vid (L.) son particularmente susceptibles a los patógenos mildiu y oídio. Los métodos convencionales para identificar y clasificar las esporas se basan en exámenes microscópicos que consumen tiempo, son susceptibles a errores humanos y requieren personal calificado. El objetivo del presente trabajo se ha centrado en el establecimiento de un protocolo para la detección molecular rápida de las especies fúngicas y de las cintas adhesivas utilizadas para atrapar esporas en colectores de inóculo atmosférico. Se probaron cuatro métodos de extracción de ADN. Posteriormente, se realizó la detección molecular de ambos patógenos validando algunos de los marcadores moleculares específicos disponibles en la literatura. La PCR con los cebadores Nad9 cob-F/Nad9 cob-R y Uncin144/Uncin511 mostró resultados específicos para y , respectivamente, y se obtuvieron los mejores resultados con el método T-CTAB. La metodología desarrollada en este trabajo podría ser de gran ayuda para relacionar la medición directa del inóculo atmosférico y el riesgo de enfermedad con la detección de patógenos, lo cual podría integrarse en el diagnóstico temprano de estos patógenos de la vid, mejorando los sistemas de alerta existentes como los Sistemas de Apoyo a la Decisión.