Los protozoos y spp. son causas comunes de enfermedades gastrointestinales en humanos y animales. Aunque ambos están comúnmente documentados en animales domésticos, pocos estudios han analizado su presencia en la vida silvestre. Para evaluar la prevalencia de ambos parásitos en jabalíes () en la Comunidad Valenciana (este de España), se recolectaron 498 muestras fecales de jabalíes desde 2018 hasta 2022. spp. se detectó mediante una PCR anidada que apunta a una secuencia de 578 pb del gen del ARN ribosomal de la subunidad pequeña (SSU rRNA), seguida de secuenciación y análisis filogenético. Para , se empleó una qPCR que amplifica un fragmento de 62 pb del SSU rRNA. Las muestras positivas fueron genotipadas para los genes de deshidrogenasa de glutamato y beta-giardina. Se consideraron diferentes factores epidemiológicos como variables moduladoras potenciales en la transmisión de ambos parásitos. La prevalencia fue del 1.20%, mientras que la prevalencia de spp. alcanzó el 21.7%. Se observó coinfección en el 0.2%. La genotipificación de los aislados solo detectó el genotipo E. Se identificaron dos especies de spp.: y Los resultados de este estudio demuestran que la exposición a spp. en jabalíes es alta, particularmente entre individuos jóvenes pertenecientes al clima mediterráneo típico. Además, la probabilidad de infección depende tanto de la temporada como de la densidad de jabalíes. Por otro lado, la exposición a G. duodenalis parece escasa y está influenciada, a su vez, por el clima. Ambas especies detectadas en el presente estudio han sido reportadas en humanos. Debido al aumento en el número de jabalíes y su colonización de áreas urbanas y periurbanas, esto podría representar un riesgo inherente para la salud de la población humana.