Para investigar la distribución y variación genética de cuatro patógenos de patos transmitidos verticalmente, incluyendo el virus de la hepatitis B de pato (DHBV), el circovirus de pato (DuCV), el virus de la hepatitis A de pato 3 (DHAV-3) y los reovirus aviares (ARV), realizamos un estudio epidemiológico utilizando ensayos de PCR y RT-PCR en una población de patos. Encontramos que el DHBV era el virus más prevalente (69.74%), seguido por el DuCV (39.48%), y luego el ARV (19.92%) y el DHAV-3 (8.49%). Entre las 271 muestras de patos, se detectaron dos, tres o cuatro virus en las mismas muestras, lo que indica que la coinfección de agentes de transmisión vertical es común en los patos. Los resultados del análisis genético mostraron que las cuatro cepas de DuCV identificadas pertenecían al genotipo 1, la cepa de DHAV-3 estaba estrechamente agrupada con cepas previamente identificadas de China, y la cepa de ARV estaba agrupada bajo el genotipo 1. Esto indica que diferentes cepas virales están circulando entre los patos. Nuestros hallazgos mejorarán el conocimiento sobre la evolución del DuCV, DHAV-3 y ARV, y ayudarán a elegir cepas adecuadas para la vacunación.