Este estudio utilizó análisis de expresión diferencial de metilación epigenómica para identificar biomarcadores primarios en pacientes con esclerosis lateral amiotrófica (ELA). Combinamos conjuntos de datos de registros médicos electrónicos de MIMIC-IV (Estados Unidos) y NHIRD (Taiwán) para explorar las comorbilidades de la ELA en profundidad y descubrir cualquier biomarcador relacionado con comorbilidades. También aplicamos word2vec a estas dos bases de datos médicas de diagnóstico clínico para medir similitudes entre la ELA y otras enfermedades similares y evaluamos la evaluación estadística de la razón de probabilidades para descubrir comorbilidades significativas en sujetos con ELA. Los candidatos a biomarcadores importantes y representativos de metilación del ADN podrían ser seleccionados de manera efectiva al comparar enfermedades similares a la ELA, genes relacionados con comorbilidades y loci de metilación diferencialmente expresados para sujetos con ELA. Los biomarcadores epigenómicos y relacionados con comorbilidades seleccionados se agruparon según sus funciones genéticas. Los candidatos a biomarcadores de metilación del ADN asociados con la ELA fueron descubiertos de manera integral. Luego, se aplicaron anotaciones de ontología génica para analizar y agrupar los biomarcadores candidatos en tres grupos diferentes según las anotaciones de funciones génicas. Los resultados mostraron que un kit de prueba potencial para la detección de ELA puede estar compuesto por , , y para una detección temprana efectiva de la ELA utilizando muestras de sangre. Al desarrollar un mecanismo efectivo de detección de biomarcadores de metilación del ADN, se puede lograr la detección temprana y el tratamiento profiláctico de pacientes con ELA de alto riesgo.