Debido a la evidente naturaleza agresiva del moho verde y al enorme daño económico que causa a los productores de champiñones comestibles, existe una necesidad urgente de medidas de prevención y control de infecciones, que deben basarse en la detección temprana de varias spp. como agentes causantes del moho verde. Las herramientas de diagnóstico más prometedoras en la actualidad se basan en métodos moleculares, aunque aún se requiere una optimización adicional para la detección en tiempo real y en el campo. En la primera parte de esta revisión, discutimos brevemente los métodos basados en el cultivo y continuamos con los métodos basados en metabolitos secundarios. Además, presentamos una visión general de los métodos moleculares comúnmente utilizados para la detección de especies/cepas. Adicionalmente, también comentamos sobre el potencial de los enfoques genómicos para la detección del moho verde. En la última parte, discutimos métodos moleculares de cribado rápido para la detección temprana de infestaciones con potencial para aplicación en el campo, en el punto de necesidad (PON), centrándonos en métodos de amplificación isotérmica. Finalmente, se resumen los desafíos actuales y las perspectivas futuras en diagnóstico en las conclusiones.