La detección y cuantificación de TaqMan qPCR de en suelo y tejidos vegetales para el manejo de enfermedades de nogal
Autores: Haegi, Anita; Luongo, Laura; Vitale, Salvatore; Tizzani, Lorenza; Belisario, Alessandra
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
La detección y cuantificación de TaqMan qPCR de en suelo y tejidos vegetales para el manejo de enfermedades de nogal
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas Generales
Palabras clave
Patógeno de plantas transmitido por el suelo
Método de detección
PCR cuantitativa en tiempo real
Gen de proteína relacionada con ras
PCR específica de Phytophthora
Huertos de nogales
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 41
Citaciones: Sin citaciones
Es un patógeno devastador de plantas transmitido por el suelo. La fuente principal de infección es el suelo, donde el patógeno puede persistir durante largos períodos. La prevención y gestión efectiva de este patógeno en cultivos de árboles requiere un método de detección temprana y fiable. En este estudio, desarrollamos un método simple, rápido, fiable y sensible basado en PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) para la detección y cuantificación directamente en muestras de plantas o suelo. Se desarrollaron cebadores dirigidos al gen nuclear de copia única de la proteína relacionada con ras, adecuados para PCR específica de Phytophthora. La especificidad del ensayo fue confirmada probándolo contra ADN genómico de 50 aislados de ocho clados diferentes de Phytophthora, incluido el muy similar . La eficiencia y fiabilidad del protocolo de qPCR se evaluaron en muestras ambientales desafiantes, como tejido vegetal de diferentes árboles hospedantes (nogal, castaño, roble) y suelos naturalmente infectados en huertos de nogales. El resultado principal fue el desarrollo de un método de qPCR para la identificación y cuantificación específica de en muestras de suelo natural. Además, este estudio estableció un método sistemático y repetible de muestreo de suelo y desarrolló una técnica eficiente de extracción de ADN del suelo para aplicar el qPCR desarrollado en suelos naturalmente infestados de huertos de nogales.
Descripción
Es un patógeno devastador de plantas transmitido por el suelo. La fuente principal de infección es el suelo, donde el patógeno puede persistir durante largos períodos. La prevención y gestión efectiva de este patógeno en cultivos de árboles requiere un método de detección temprana y fiable. En este estudio, desarrollamos un método simple, rápido, fiable y sensible basado en PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) para la detección y cuantificación directamente en muestras de plantas o suelo. Se desarrollaron cebadores dirigidos al gen nuclear de copia única de la proteína relacionada con ras, adecuados para PCR específica de Phytophthora. La especificidad del ensayo fue confirmada probándolo contra ADN genómico de 50 aislados de ocho clados diferentes de Phytophthora, incluido el muy similar . La eficiencia y fiabilidad del protocolo de qPCR se evaluaron en muestras ambientales desafiantes, como tejido vegetal de diferentes árboles hospedantes (nogal, castaño, roble) y suelos naturalmente infectados en huertos de nogales. El resultado principal fue el desarrollo de un método de qPCR para la identificación y cuantificación específica de en muestras de suelo natural. Además, este estudio estableció un método sistemático y repetible de muestreo de suelo y desarrolló una técnica eficiente de extracción de ADN del suelo para aplicar el qPCR desarrollado en suelos naturalmente infestados de huertos de nogales.