, un eucariote intracelular estrechamente relacionado con los hongos, es reconocido como un patógeno significativo que afecta a los humanos, particularmente a aquellos con sistemas inmunológicos comprometidos. Aunque sus rutas de transmisión aún no están completamente elucidada, la transmisión fecal-oral sigue siendo la principal. Con un amplio rango de hospedadores, el potencial zoonótico de es una preocupación, aunque la evidencia directa de transmisión de animales a humanos sigue siendo escasa. La genotipificación basada en la región del espaciador transcrito interno (ITS) facilita la delimitación de la diversidad genética, con genotipos potencialmente zoonóticos predominantemente asociados con los Grupos 1 y 2. A pesar del amplio espectro de hospedadores animales susceptibles, la investigación sobre la infección por microsporidios entre animales de zoológico sigue siendo limitada. Este estudio tuvo como objetivo evaluar la ocurrencia de infección en diversos animales en cautiverio, centrándose en entornos de zoológicos en Portugal. Se recolectaron muestras fecales de una variedad de animales, y se realizó la detección molecular de utilizando PCR anidada dirigida a la región ITS. De 127 muestras fecales, el 1.57% (IC del 95%: 0.19-5.57) dio positivo para , con primates no humanos (NHP"s) exhibiendo una ocurrencia del 18.18% (IC del 95%: 2.28-51.78). El análisis filogenético reveló agrupamientos dentro de los genotipos del Grupo 2, indicando posibles implicaciones zoonóticas. Este estudio destaca la necesidad de más investigación para comprender la epidemiología de en entornos de zoológico y sus posibles vías de transmisión a los humanos.