Los flavonoides son metabolitos secundarios que son beneficiosos para las actividades vitales y se concentran principalmente en los brotes y hojas en forma de glicosidos. Los glicosidos de flavonoides tienen efectos importantes en las propiedades y calidad de las plantas de té. La investigación ha demostrado que la abundancia de glicosidos de flavonoides varía considerablemente entre diferentes cultivares, pero falta investigación sobre los mecanismos regulatorios que causan su acumulación diferencial entre cultivares de plantas de té con diferentes colores de hojas. En este estudio, se realizó un análisis integrado de metabolómica y transcriptómica para determinar las redes regulatorias que regulan la astringencia y los flavonoides relacionados con el color en cultivares de plantas de té con diversos colores de hojas. Se encontraron un total de cinco antocianidinas, cuatro catequinas y nueve glicosidos de flavonol que contribuyen parcialmente a las diferencias en el sabor y el color de las hojas entre cultivares de plantas de té con diversos colores de hojas. Además, se identificaron 15 genes y 5 genes como posibles reguladores que controlan la expresión de ocho genes estructurales clave, lo que resulta en diferencias en la acumulación de compuestos específicos, incluyendo epicatequina (EC), catequina (C), cianidina, cianidina 3-O-glucósido, pelargonidina 3-O-glucósido y quercetina 3-O-glucósido, en cultivares de plantas de té con diversos colores de hojas. Estos hallazgos proporcionan información sobre el desarrollo y la utilización de recursos de plantas de té con diversos colores de hojas.