La retención de cobre (Cu) en suelo salino- alcalino (SAS) durante la aplicación a largo plazo de residuos de biogás (BR) con una alta concentración de Cu genera preocupaciones. En este trabajo, se detectó el destino del Cu utilizando isotermas de adsorción, microscopio electrónico de barrido-espectrómetro de dispersión de energía, espectrómetro infrarrojo por transformada de Fourier, difracción de rayos X, calorimetría de titulación isotérmica, espectroscopía de fotoelectrones de rayos X y espectrómetro de fluorescencia de rayos X de microzona. Los resultados mostraron que los grupos principales para la adsorción de Cu por SAS y BR fueron carboxilo, hidroxilo, amida y amina. La adsorción de Cu por el grupo carboxilo fue coimpulsada por entropía-entalpía (|H| < |TS|, H < 0). La adsorción de Cu por el grupo de amina fue impulsada por entropía (|H| > |TS|, H > 0). La adsorción de Cu en el SAS y BR se logró mediante materia orgánica en lugar de minerales. La degradación de BR en el SAS aumenta el contenido de grupos de adsorción de Cu como los grupos carboxilo y amina, y Cu se adsorbió en la superficie o en el interior de SAS a través de grupos orgánicos. Este estudio proporciona un mayor apoyo teórico para la aplicación de BR en SAS.