La mineralización excesiva de moléculas orgánicas durante la fermentación anaeróbica aumenta la disponibilidad de nitrógeno y carbono. Por esta razón, se requiere el desarrollo de tecnologías de procesamiento secundario para gestionar mejor las emisiones de amoníaco y dióxido de carbono durante el almacenamiento y la aplicación en tierra de la enmienda orgánica del suelo resultante.