El número de macollos (TN) es un rasgo importante que contribuye al rendimiento en arroz (L.). Un conjunto de 76 líneas de sustitución de segmentos cromosómicos (CSSLs) derivadas del cruce super-híbrido entre Zhonghui 9308 (ZH9308) y Xieqingzao B (XQZB) se utilizó para mapear loci de rasgos cuantitativos (QTL) que controlan el número de macollos (TN). Se detectaron un total de cuatro QTL en Fuyang, provincia de Zhejiang (30.15 grados N, 120 grados E). Dos QTL se detectaron en Lingshui, provincia de Hainan (18.5 grados N, 110 grados E) en nuestro estudio anterior. Para mapear aún más el QTL en el cromosoma 4, la línea CSSL29 con un número de macollos más bajo fue seleccionada para cruzarse con ZH9308 y desarrollar la población F secundaria. En la población F, se validó y posteriormente se redujo a una región de 4.08 Mb. Además, combinando fenotipo con genotipo, se desglosó en dos QTL en la población F. El y explicaron el 34.31% y el 32.05% de la varianza fenotípica, con un efecto aditivo de 1.47 y 1.38, respectivamente. Finalmente, el y se mapearon con precisión en intervalos de 193.55 Kb y 175.12 Kb en el cromosoma 4, respectivamente. Basándose en el genotipo y fenotipo, se seleccionaron cuatro líneas casi isogénicas (NILs) en las poblaciones de mapeo. En comparación con NIL, el número de macollos (TN), la tasa de cuajado de granos, la longitud del grano (GL), la relación de longitud del grano al ancho (LWR) y el rendimiento de grano por planta de NIL, NIL- y NIL- aumentaron, y la fecha de espigado de estas tres líneas fue anterior a la de NIL. Curiosamente, entre los genes candidatos de y , excepto por , ninguno de los otros genes ha sido clonado, lo que indica la existencia de un gen novedoso que controla el número de macollos. Estos resultados sientan las bases para el análisis de QTL que controlan el número de macollos en ZH9308 y proporcionan una base teórica para la aplicación de ZH9308 en la cría super-híbrida.