Desentrañando los Guardianes del Crecimiento: Un Análisis Integral de las Familias de Genes / y en
Autores: Cai, Kewei; Zhao, Qiushuang; Zhang, Jinwang; Yuan, Hongtao; Li, Hanxi; Han, Lu; Li, Xuebo; Li, Kailong; Jiang, Tingbo; Zhao, Xiyang
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
Desentrañando los Guardianes del Crecimiento: Un Análisis Integral de las Familias de Genes / y en
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Auxina
ácido indol-3-acético
Familias de genes
Vía de señalización
Ubicación cromosómica
árboles filogenéticos
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 9
Citaciones: Sin citaciones
Los genes de auxina/ácido indol-3-acético y el factor de respuesta a auxina son dos familias de genes cruciales en la vía de señalización de auxina en las plantas. No obstante, hay un conocimiento limitado sobre las familias de genes en este contexto. En este estudio, primero identificamos 33 genes putativos y 35 en el genoma. El análisis de la ubicación cromosómica mostró que los genes estaban distribuidos de manera desigual en 17 cromosomas, con la mayor abundancia observada en el cromosoma 2. Además, basándonos en la homología de los genes, se construyeron dos árboles filogenéticos, clasificando 33 y 35 en tres subgrupos cada uno. Se identificaron cinco pares de genes como resultado de duplicación en tándem, pero no se encontraron pares de genes repetidos en tándem en la familia. El perfil de expresión de los genes reveló que varios genes mostraron una regulación positiva en diferentes tejidos y bajo diversas condiciones de estrés, lo que indica sus posibles roles clave en el desarrollo de las plantas y las respuestas al estrés. La variación en los patrones de expresión de genes específicos fue corroborada a través de análisis de RT-qPCR. Lo más importante es que establecimos que el gen, funcionando como un centro neurálgico, exhibe interacciones con numerosas proteínas Aux/IAA y ARF. Además, los hallazgos de localización subcelular indican que el gen funciona como una proteína localizada dentro del núcleo. Para concluir, el análisis en profundidad proporcionado en este estudio contribuirá significativamente a avanzar nuestro conocimiento sobre los roles desempeñados por las familias de genes en el desarrollo de tejidos y sus respuestas al estrés. Los conocimientos adquiridos servirán como un activo valioso para futuras investigaciones sobre las funciones biológicas de estas familias de genes.
Descripción
Los genes de auxina/ácido indol-3-acético y el factor de respuesta a auxina son dos familias de genes cruciales en la vía de señalización de auxina en las plantas. No obstante, hay un conocimiento limitado sobre las familias de genes en este contexto. En este estudio, primero identificamos 33 genes putativos y 35 en el genoma. El análisis de la ubicación cromosómica mostró que los genes estaban distribuidos de manera desigual en 17 cromosomas, con la mayor abundancia observada en el cromosoma 2. Además, basándonos en la homología de los genes, se construyeron dos árboles filogenéticos, clasificando 33 y 35 en tres subgrupos cada uno. Se identificaron cinco pares de genes como resultado de duplicación en tándem, pero no se encontraron pares de genes repetidos en tándem en la familia. El perfil de expresión de los genes reveló que varios genes mostraron una regulación positiva en diferentes tejidos y bajo diversas condiciones de estrés, lo que indica sus posibles roles clave en el desarrollo de las plantas y las respuestas al estrés. La variación en los patrones de expresión de genes específicos fue corroborada a través de análisis de RT-qPCR. Lo más importante es que establecimos que el gen, funcionando como un centro neurálgico, exhibe interacciones con numerosas proteínas Aux/IAA y ARF. Además, los hallazgos de localización subcelular indican que el gen funciona como una proteína localizada dentro del núcleo. Para concluir, el análisis en profundidad proporcionado en este estudio contribuirá significativamente a avanzar nuestro conocimiento sobre los roles desempeñados por las familias de genes en el desarrollo de tejidos y sus respuestas al estrés. Los conocimientos adquiridos servirán como un activo valioso para futuras investigaciones sobre las funciones biológicas de estas familias de genes.