Aunque las comunidades microbianas del líquido seminal eran un campo inexplorado hace algunas décadas, sus características y roles potenciales están saliendo gradualmente a la luz. Por lo tanto, se ha comenzado a revelar una población compleja y específica de microbioma con nichos comensales y especies fluctuantes. De hecho, ciertos grupos de bacterias se han asociado con la fertilidad y la salud, mientras que el crecimiento de varias especies está potencialmente correlacionado con indicadores de infertilidad. Esto constituye una razón convincente para delinear los elementos externos que pueden inducir cambios en la composición del microbioma seminal, como factores de estilo de vida, microbiota intestinal, patologías, prebióticos y probióticos. En esta revisión, resumimos los principales hallazgos sobre el microbioma seminal, sus orígenes y composición, su relación con la fertilidad, la salud y los factores de influencia, al tiempo que recordamos a los lectores las limitaciones y ventajas introducidas por las variabilidades técnicas durante los procedimientos experimentales.