La cría cruzada forma parte de la producción de carne de res inteligente para el clima y es una de las estrategias para mitigar los efectos del cambio climático. Dos animales cruzados de Nguni y tres de Bonsmara fueron sometidos a secuenciación del genoma completo. Tras el control de calidad y la preparación de archivos, los datos de secuencia se investigaron en busca de variación en el número de copias a nivel genómico (CNV) utilizando la herramienta panelcn.MOPS. Se identificaron un total de 355 CNV en los cruzados, de los cuales 274 eran únicos en los cruzados de Bonsmara y 81 únicos en los cruzados de Nguni. Los genes que diferían en número de copias en ambos cruzados incluían genes relacionados con el crecimiento (SCRN2, LOC109572916) y factores relacionados con la fertilidad (RPS28, LOC1098562432, LOC109570037). Los genes que estaban presentes solo en los cruzados de Bonsmara incluían genes relacionados con el metabolismo de lípidos (MAF1), olfacción (LOC109569114), tamaño corporal (HES7), inmunidad (LOC10957335, LOC109877039) y enfermedades (DMBT1). Los genes que estaban presentes solo en los cruzados de Nguni incluían genes relacionados con la cetosis (HMBOX1) y el transporte de aminoácidos (LOC109572916). Los resultados de este estudio indican que el ganado Nguni y Bonsmara pueden ser utilizados en programas de cría cruzada, ya que pueden mejorar la presencia de rasgos económicamente importantes asociados con ambas razas. Esto producirá animales cruzados que son buenos productores de carne, crecen más rápido, tienen alta fertilidad, fuerte inmunidad y una mejor oportunidad de producir en las duras condiciones climáticas de Sudáfrica. En última instancia, este estudio proporciona nuevas perspectivas genéticas sobre la adaptabilidad del ganado cruzado Nguni y Bonsmara.