Las especies de , uno de los géneros más grandes de la familia Apiaceae, se cultivan tradicionalmente con fines medicinales. En este estudio, se utilizó la tecnología de secuenciación de ADN asociado a sitios de restricción de doble digestión de alto rendimiento (ddRAD-seq) para identificar polimorfismos de nucleótido único (SNP) en ocho especies de Irán. Después de la doble digestión con las enzimas HpyCH4IV y HinfI, un total de 334,702,966 lecturas emparejadas de extremo a extremo se ensamblaron de novo en 1,270,791 loci con un promedio de 28.8 lecturas por locus. Después de un filtrado estricto, se identificaron 2440 SNPs de alta calidad para el análisis posterior. El análisis de relaciones genéticas y estructura de la población, basado en estos SNPs retenidos, indicó la presencia de tres grupos principales. La ontología génica y el análisis de vías se determinaron mediante la comparación de secuencias flanqueantes asociadas a SNP con una base de datos pública no redundante. Debido a la falta de recursos genómicos en este género, nuestro presente estudio es el primer informe que proporciona SNPs de alta calidad en basado en un análisis de novo utilizando ddRAD-seq. Estos datos mejorarán el conocimiento molecular del género y proporcionarán una fuente importante de información para los criadores y la comunidad de investigación para mejorar los programas de cría y apoyar la gestión de recursos genómicos.