El estudio de asociación del genoma completo revela nuevos loci de resistencia al oídio en el trigo pan
Autores: Kaur, Ramandeep; Vasistha, Neeraj Kumar; Ravat, Vikas Kumar; Mishra, Vinod Kumar; Sharma, Sandeep; Joshi, Arun Kumar; Dhariwal, Raman
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2023
Acceso abierto
Artículo científico
2023
El estudio de asociación del genoma completo revela nuevos loci de resistencia al oídio en el trigo pan
Categoría
Ciencias Agrícolas y Biológicas
Subcategoría
Botánica
Palabras clave
Mildiú polvoriento
Producción de trigo
Estudio de asociación a nivel genómico
Polimorfismo de un solo nucleótido
Resistencia a enfermedades
Programas de mejoramiento
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 8
Citaciones: Sin citaciones
El oídio (PM), causado por el patógeno fúngico f. sp. (), amenaza significativamente la producción global de trigo pan. Aunque el uso de cultivares resistentes es una estrategia efectiva para manejar el PM, los cultivares de trigo actualmente disponibles carecen de niveles suficientes de resistencia. Para abordar este desafío, realizamos un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) utilizando un panel diverso de 286 genotipos de trigo pan. Durante tres años consecutivos (2020-2021, 2021-2022 y 2022-2023), estos genotipos fueron evaluados extensamente por la severidad del PM en condiciones de campo tras la inoculación con aislados virulentos. El panel fue genotipado previamente utilizando el ensayo Illumina 90K Infinium iSelect para obtener cobertura de marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) a nivel del genoma. Al aplicar FarmCPU, un modelo mixto de múltiples loci, identificamos un total de 113 asociaciones marcador-característica (MTA) ubicadas en los cromosomas 1A, 1B, 2B, 3A, 3B, 4A, 4B, 5A, 5B, 6B, 7A y 7B a un nivel de significancia de
Descripción
El oídio (PM), causado por el patógeno fúngico f. sp. (), amenaza significativamente la producción global de trigo pan. Aunque el uso de cultivares resistentes es una estrategia efectiva para manejar el PM, los cultivares de trigo actualmente disponibles carecen de niveles suficientes de resistencia. Para abordar este desafío, realizamos un estudio de asociación del genoma completo (GWAS) utilizando un panel diverso de 286 genotipos de trigo pan. Durante tres años consecutivos (2020-2021, 2021-2022 y 2022-2023), estos genotipos fueron evaluados extensamente por la severidad del PM en condiciones de campo tras la inoculación con aislados virulentos. El panel fue genotipado previamente utilizando el ensayo Illumina 90K Infinium iSelect para obtener cobertura de marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) a nivel del genoma. Al aplicar FarmCPU, un modelo mixto de múltiples loci, identificamos un total de 113 asociaciones marcador-característica (MTA) ubicadas en los cromosomas 1A, 1B, 2B, 3A, 3B, 4A, 4B, 5A, 5B, 6B, 7A y 7B a un nivel de significancia de