El marsopa sin aleta del Yangtsé sirve como una especie clave para evaluar la efectividad de las prohibiciones de pesca y evaluar la salud ecológica del ecosistema del río Yangtsé, en China. Para proporcionar marcadores moleculares estables y confiables para estudios genéticos de población, este estudio utilizó datos genómicos de alta calidad a nivel de cromosoma del marsopa sin aleta del Yangtsé junto con datos de resecuenciación de 12 individuos para identificar loci microsatélites altamente variables. Al integrar la amplificación por PCR con la tecnología de electroforesis capilar, este estudio validó con éxito un total de 19 loci microsatélites de repetición de tetranucleótidos que exhiben amplificación estable, alto polimorfismo y bajas tasas de error en la genotipificación. Usando estos marcadores moleculares, se realizó un análisis de diversidad genética en la población del lago Poyang para evaluar sus ventajas funcionales y aplicabilidad. Los marcadores microsatélites desarrollados en este estudio sirven como una herramienta crítica para identificar con precisión las relaciones genéticas entre los marsopas sin aleta del Yangtsé y predecir de manera confiable la dinámica poblacional.