La determinación precisa de la cantidad de glicosaminoglicanos (GAGs) en una mezcla compleja de matriz extracelular (ECM) es importante para la morfogénesis y la homeostasis del tejido. El objetivo del presente estudio fue investigar un método de azul alciano (AB) preciso, simple y sensible para cuantificar heparina en muestras biológicas. Se desarrolló un método para analizar heparina y se evaluaron parámetros como volumen, tiempo de precipitación, componente del disolvente y tiempo de solubilidad. Se permitió que el colorante AB y las muestras de heparina reaccionaran a 4 degreesC durante 24 h. El complejo heparina-AB se disolvió en 25 N de NaOH y 2-aminoetanol (1:24). La densidad óptica de la solución se analizó mediante espectrometría UV-Vis a 620 nm. El método AB modificado fue validado de acuerdo con las pautas de la Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. Se encontró que el límite de detección era de 2.95 ug/mL. La precisión intradía e interdía osciló entre 2.14-4.83% y 3.16-7.02% (n = 9), respectivamente. La recuperación general para tres niveles de concentración varió entre 97 +/- 3.5%, confirmando una buena precisión. Además, este estudio ha descubierto la naturaleza interdisciplinaria de la detección de proteínas utilizando el método AB. La base de esta investigación fue que la proteína fibrosa inhibe el complejo heparina-AB, mientras que la proteína globular no lo hace. Además, medimos el contenido de GAGs sulfatados (sGAGs; expresados como equivalente de heparina) en la ECM de hígado porcino descelularizado. En conclusión, el método AB puede ser utilizado para el análisis cuantitativo de heparina en andamios de ECM para aplicaciones de ingeniería de tejidos.