En este estudio, investigamos una enfermedad respiratoria que afecta a las gallinas en el sur de Chile. Aunque los registros oficiales no han reportado ningún caso desde 2011, esto probablemente refleja una falta de control y monitoreo más que la ausencia real de la enfermedad. Los veterinarios locales sospechaban infecciones en gallinas de traspatio que nunca habían sido vacunadas. Examinamos muestras de estas aves y encontramos evidencia clara del virus. Nuestro análisis mostró que el virus era genéticamente similar a las cepas utilizadas en las vacunas, lo que genera preocupaciones sobre la propagación involuntaria de virus relacionados con la vacuna a través del contacto indirecto, como equipos contaminados o exposición al medio ambiente. Estos hallazgos sugieren que la enfermedad puede estar circulando silenciosamente en pequeños grupos no comerciales que no están incluidos en la vigilancia rutinaria. Utilizando una técnica de laboratorio para detectar y analizar el material genético del virus, identificamos qué cepas estaban presentes y cómo podrían haberse propagado. Nuestros resultados destacan una brecha entre los datos oficiales y las condiciones reales en el campo. Fortalecer el monitoreo de enfermedades en sistemas de traspatio podría ayudar a descubrir brotes ocultos, guiar estrategias de vacunación más efectivas y mejorar la salud avícola y la bioseguridad en todo el país.