Dirigiendo el polipéptido para diseñar una potencial vacuna multiepítopo contra (OHFV) mediante la evaluación de alergenicidad, antigenicidad y toxicidad utilizando enfoques inmunoinformáticos
Autores: Alnuqaydan, Abdullah M.; Eisa, Alaa Abdulaziz
Idioma: Inglés
Editor: MDPI
Año: 2024
Acceso abierto
Artículo científico
2024
Dirigiendo el polipéptido para diseñar una potencial vacuna multiepítopo contra (OHFV) mediante la evaluación de alergenicidad, antigenicidad y toxicidad utilizando enfoques inmunoinformáticos
Categoría
Ciencias Naturales y Subdisciplinas
Subcategoría
Biología
Palabras clave
Virus
Vacuna
OHFV
Inmune
Epítopos
TLR4
Licencia
CC BY-SA – Atribución – Compartir Igual
Consultas: 15
Citaciones: Sin citaciones
El virus de la fiebre hemorrágica de Omsk (OHFV) es un virus de ARN con un genoma de cadena sencilla y sentido positivo. Se clasifica dentro de la familia Flaviviridae. El genoma de este virus es un 98% similar al virus de la fiebre hemorrágica de Alkhurma (AHFV), que pertenece a la misma familia. Se han reportado casos del virus en varias regiones de Arabia Saudita. Tanto OHFV como AHFV tienen similitudes en los objetivos de polipéptidos patogénicos. No hay vacunas efectivas y autorizadas disponibles para manejar las infecciones por OHFV. Por lo tanto, se requiere una vacuna efectiva y segura que pueda activar la inmunidad protectora contra OHFV. El estudio actual tuvo como objetivo diseñar una vacuna subunitaria multiepítopo contra el OHFV utilizando varias herramientas de inmunoinformática. Se seleccionó el polipéptido de OHFV y se eligieron epítopos potentes, no alérgicos y no tóxicos para linfocitos T citotóxicos (CTL), linfocitos T ayudantes (HTL) y epítopos lineales de linfocitos B (LBL). Después de la selección, se unieron ocho (8) epítopos CTL, cinco (5) epítopos HTL y seis (6) epítopos de células B entre sí utilizando diferentes conectores. También se vinculó el adyuvante defensina beta humana-2 a los epítopos para aumentar la eficiencia antigénica e inmunogénica de la vacuna. La vacuna diseñada se acopló con el receptor tipo Toll 4 (TLR4) ya que activa e induce respuestas inmunitarias primarias y secundarias contra OHFV. Se llevó a cabo la optimización de codones, lo que resultó en un valor de CAI de 0.99 y un contenido de GC del 53.4%. Además, el constructo se acopló ciegamente al receptor inmune TLR4 y se sometió a un análisis de simulación de dinámica conformacional para interpretar la afinidad intrincada y comprender el comportamiento dependiente del tiempo. Además, se predijo que las respuestas inmunitarias al constructo de vacuna desarrollado reportaron la formación de células inmunitarias humorales y celulares fuertes. Por lo tanto, la vacuna propuesta puede ser considerada en ensayos experimentales para combatir las infecciones por OHFV. Los experimentos de laboratorio para las predicciones anteriores son esenciales para evaluar la efectividad, seguridad y propiedades protectoras del sujeto en cuestión.
Descripción
El virus de la fiebre hemorrágica de Omsk (OHFV) es un virus de ARN con un genoma de cadena sencilla y sentido positivo. Se clasifica dentro de la familia Flaviviridae. El genoma de este virus es un 98% similar al virus de la fiebre hemorrágica de Alkhurma (AHFV), que pertenece a la misma familia. Se han reportado casos del virus en varias regiones de Arabia Saudita. Tanto OHFV como AHFV tienen similitudes en los objetivos de polipéptidos patogénicos. No hay vacunas efectivas y autorizadas disponibles para manejar las infecciones por OHFV. Por lo tanto, se requiere una vacuna efectiva y segura que pueda activar la inmunidad protectora contra OHFV. El estudio actual tuvo como objetivo diseñar una vacuna subunitaria multiepítopo contra el OHFV utilizando varias herramientas de inmunoinformática. Se seleccionó el polipéptido de OHFV y se eligieron epítopos potentes, no alérgicos y no tóxicos para linfocitos T citotóxicos (CTL), linfocitos T ayudantes (HTL) y epítopos lineales de linfocitos B (LBL). Después de la selección, se unieron ocho (8) epítopos CTL, cinco (5) epítopos HTL y seis (6) epítopos de células B entre sí utilizando diferentes conectores. También se vinculó el adyuvante defensina beta humana-2 a los epítopos para aumentar la eficiencia antigénica e inmunogénica de la vacuna. La vacuna diseñada se acopló con el receptor tipo Toll 4 (TLR4) ya que activa e induce respuestas inmunitarias primarias y secundarias contra OHFV. Se llevó a cabo la optimización de codones, lo que resultó en un valor de CAI de 0.99 y un contenido de GC del 53.4%. Además, el constructo se acopló ciegamente al receptor inmune TLR4 y se sometió a un análisis de simulación de dinámica conformacional para interpretar la afinidad intrincada y comprender el comportamiento dependiente del tiempo. Además, se predijo que las respuestas inmunitarias al constructo de vacuna desarrollado reportaron la formación de células inmunitarias humorales y celulares fuertes. Por lo tanto, la vacuna propuesta puede ser considerada en ensayos experimentales para combatir las infecciones por OHFV. Los experimentos de laboratorio para las predicciones anteriores son esenciales para evaluar la efectividad, seguridad y propiedades protectoras del sujeto en cuestión.