Los sistemas de colas (QS) representan la vida cotidiana en todos los sistemas empresariales y económicos. Por un lado, existe una tendencia hacia la optimización de su tiempo y costo, pero por otro lado, no han sido suficientemente explorados. Esto se aplica especialmente a los sistemas logísticos, donde aparece un gran número de unidades de transporte y almacenamiento. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo es desarrollar un modelo ANFIS (sistema de inferencia neuro-difusa adaptativa) en un sistema de almacén con dos servidores para definir los parámetros de optimización de QS. La investigación se llevó a cabo en una empresa dedicada a la fabricación de papel marrón ubicada en el territorio de Bosnia y Herzegovina, que representa una parte significativa de la producción total de exportación del país. En este trabajo, el criterio de optimización es el tiempo pasado en el sistema, que es importante tanto desde el aspecto de todos los clientes del sistema como desde el del propietario de la empresa. El criterio de tiempo afecta directamente la eficiencia del sistema, pero también los costos generales que este sistema provoca. El modelo ANFIS desarrollado se comparó con un modelo matemático a través de un análisis de sensibilidad. El modelo matemático mostró resultados sobresalientes, lo que justifica su desarrollo y aplicación.