Las coníferas son un grupo de plantas con semillas que son ecológica y económicamente importantes y que pueden proporcionar información significativa sobre la evolución de las plantas terrestres. La filogenética molecular se ha desarrollado como un enfoque importante en los estudios evolutivos, aunque ha habido relativamente pocos estudios de coníferas que empleen datos a gran escala provenientes de múltiples genes nucleares. La secuenciación de enriquecimiento por captura de objetivos (captura de objetivos, captura de exones o Hyb-Seq) se ha desarrollado como un enfoque clave en los estudios filogenómicos modernos. Sin embargo, hasta ahora, no ha existido un conjunto de cebos que apunte específicamente a todo el clado de coníferas. REMcon es un conjunto de sondas de captura de secuencias de objetivos destinado a estudios filogenéticos a nivel de familia y especie de coníferas que apunta a aproximadamente 100 loci nucleares de copia única. Probamos el conjunto de sondas REMcon utilizando 69 especies, incluyendo 44 géneros de coníferas de seis familias y cuatro otros taxones de gimnospermas, para evaluar la eficiencia de la captura de objetivos para generar de manera eficiente datos de secuencia de ADN comparables entre coníferas. La recuperación de loci objetivo fue alta, con un promedio del 94% de las regiones objetivo recuperadas en muestras con alta cobertura de lectura. Un análisis filogenético de estos datos produjo una topología bien soportada que es consistente con la comprensión actual de las relaciones entre coníferas. El conjunto de cebos REMcon será útil para generar conjuntos de datos nucleares relativamente grandes de manera consistente para cualquier linaje de coníferas.