Los nematodos de nudos radicales inducen la formación de sitios de alimentación dentro de las raíces del huésped y la reubicación de auxina en los agallas resulta en un crecimiento anormal de las raíces laterales. Aquí, analizamos los cambios en la arquitectura de las raíces de pepino bajo estrés y la distribución de auxina en estos cambios morfológicos y moleculares de las raíces. El número de puntas de raíces disminuyó significativamente, y el análisis de regresión mostró una relación positiva entre el tamaño de las agallas radiculares y el número de nematodos en las agallas en comparación con las raíces laterales en las agallas, enfatizando el efecto del parasitismo de nematodos en el desarrollo de las raíces. Los datos generados a través de un sistema promotor-reportero utilizando el sistema de raíces peludas transgénicas caracterizaron por primera vez la distribución de auxina durante el parasitismo de nematodos en pepino. Usando tinción de agallas radiculares, detectamos además la expresión de y , que regulan el transporte polar de auxina. Los resultados mostraron que tanto como fueron inducidos en las agallas, y la expresión relativa de los dos genes aumentó significativamente a los 21 DAI. El tratamiento con TIBA, que puede interrumpir el transporte polar de auxina, inhibió el número de puntas de raíces de pepino y la longitud total siguiendo gradientes de concentración crecientes. Además, el número de agallas se vio significativamente afectado por el tratamiento con TIBA, lo que mostró el papel vital de la auxina durante el parasitismo de nematodos. Nuestros hallazgos sugieren que el transporte de auxina juega un papel importante durante la formación de agallas e induce el desarrollo de raíces laterales de pepino dentro de los sitios de alimentación de nematodos.